Die Hauptstadt der Insel heißt Mykonos. Stadt, auch Chora genannt, die Häuser hier liegen wie kleine weiße Zuckerwürfel, entlang der Bucht und des Hafens. Mykonos- Stadt sieht man oft auf Postkarten, das Motiv steht für Griechenland wie man es kennt. Im Hafen von Mykonos- Stadt liegen neben den Fischerbooten, Luxusyachten und Kreuzfahrtschiffe. Oberhalb der Stadt sieht man die alten Windmühlen, welche das Wahrzeichen der Insel sind.
In der Altstadt von Mykonos- Stadt befinden sich enge alte Gassen, trotz das der Tourismus in Mykonos- Stadt Oberhand besitzt, konnte die Stadt sich in der Altstadt ihr ursprüngliches Flair behalten, schlendert man hier entlang, s. fühlt man sich in eine andere Zeit zurück versetzt. Zwischen der Altstadt und dem Hafen befinden sich einige der wenigen Sehenswürdigkeiten der Insel, wie das archäologische Museum , oder das Seefahrtsmuseum. Die Hauptattraktion der Stadt ist das Viertel Klein Venedig. In diesem Viertel, mit Häusern aus der Zeit der türkischen Besetzung, befinden sich zahlreiche Restaurants und Tavernen.
Das Nachtleben von Mykonos- Stadt ist legendär, erst wird die Nacht in einer der unzähligen Bar. eingeläutet, dann geht es in die Diskotheken im Hafenviertel, von dort aus im Morgengrauen zum Jachtclub. Da in Mykonos- Stadt aufgrund der engen Gassen, der Autoverkehr teilweise ganz verboten ist, lohnt sich ein entspannter Bummel durch die Stadt, zahllose kleinere Geschäfte, sowie edle Boutiquen, oder Filialen bekannter Bekleidungsketten, laden zum gemütlichen Einkaufen ein.