Die Bay Island. sind eine der bedeutenden touristischen Zonen von Honduras. Sie liegen vor der Küste und bestehen aus Roatan, Utila, Guanaja und dem Cayos Cochinos Archipelago. Roatan ist die größte und erschlossenste Insel der Bay Islands und besonders für Wassersportler ein Paradies. Utila ist deutlich flacher. Fast die gesamte Bevölkerung lebt in East Harbour, einige Hundert leben auf dem vorgelagerten Pidgeon Cay. Man kann hier preisgünstiger tauchen lernen als anderswo, die Ferienresorts sind aus allen Preisklassen. Guanaja lockt mit phantastischen Stränden und großartigen Riffen. Christopher Columbus nannte sie die Insel der Pinien. Die meisten Bewohner leben auf dem Bonaca Cay, die Hauptorte auf Guanaja sind Mangrove Bight and Savannah Bight. Auch hier kann man an vielen Tauchspots, Wracks und Riffen tauchen, findet aber deutlich mehr Abgeschiedenheit als auf den anderen Bay Islands. Das Cayos Cochinos Archipelago ist im Inselkern dicht bewaldet, außen aber von weißen Stränden umgeben. Man findet nur wenige Ferienresorts der höheren Preisklasse.
Auf Guanaja kann man wandern und Wasserfälle entdecken, außerdem gibt es Höhlen und einen neuen Tauchspot, an dem unter anderem spanische Kanonen, eine Statue von Christopher Columbus und anderes zu entdecken sind. Rund um die Cayos Inseln findet sich ein Marinereservat, in dem Taucher und Schnorchler eine Vielfalt von Lebensformen entdecken können. Der Pico Bonito Nationalpark unweit von La Ceiba gilt vielen als der schönste Platz in Honduras. Auch die Ruinen von Copan sind erreichbar und lohnen einen mehrtägigen Besuch. Man kann auch eine Garifuna Village namens Nueva Armenia erreichen.